Rafael Silva é natural e Sete Lagoas, estado de Minas Gerais, no Brasil. Jogou nos escalões de formação do Ponte Preta e foi de lá que em 2022 chegou para os sub-19 do Real Valladolid CF. Meia temporada volvida deu-se o regresso ao Brasil, desta vez para jogar nos sub-20 do Cruzeiro, onde venceu o campeonato Mineiro deste escalão.
Chegou ao Sporting CP após meia temporada ao serviço do Leixões SC, onde se revelou uma peça importante na defesa da equipa de Matosinhos. Feliz e motivado por representar o Sporting, afirma que este é o momento mais alto da sua carreira e espera corresponder da melhor forma em campo. Meia temporada volvida sagrou-se campeão nacional pelos Leões.