Miguel Alves passou os primeiros anos de formação em clubes da AF Coimbra. Passou pelo GD Os Águias e CF Os Marialvas, com um ano no SL Benfica pelo meio.
Tem contrato de formação desde 2021, fez parte da equipa campeã nacional de sub-17, em 2022 e desde 2023 que é internacional sub-18 por Portugal.
Em 2022/23 esteve integrado no escalão sub-19 e transitou em 2023/24 para a equipa B, que continua a competir na Liga 3.