Francisco Canário é natural de Portalegre e, tal como o pai, ex-jogador de futebol e hoje treinador, começou a jogar no Sport Clube Estrela, da sua cidade natal. Assinou pelo Sporting CP a 29 de setembro de 2012, para actuar na equipa de benjamins dos Leões, enquento treinava durante a semana no clube onde iniciou a formação. Campeão distrital e nacional de iniciados ao serviço do Sporting, rumou em 2020 ao Vitória SC.

O regresso aos Leões aconteceu em junho de 2022, graças a uma temporada de grande nível ao serviço dos juniores vitorianos, onde marcou 16 golos em 21 encontros disputados. Feliz pelo regresso, Canário chegou mais maduro ao Clube do seu coração e mostra-se satisfeito com a sua evolução, que agora espera materializar, aproveitando todas as oportunidades.