Natural de Lisboa, Margarida Arriaga e Cunha começou a jogar râguebi aos catorze anos na equipa sénior da AEIS Agronomia. Ao longo de dez temporadas participou na histórica conquista da Taça de Portugal de Tens, a primeira conquista da equipa feminina da Agronomia.
O interregno de dois anos, entre 2014 e 2016, coincidiu com a criação da equipa feminina de râguebi do Sporting CP e o convite para vestir de leão ao peito bateu forte no seu coração de Leoa. Regressou à modalidade e ajudou o Sporting a conquistar cinco campeonatos nacionais, três taças de Portugal, uma Taça Ibérica e duas Supertaças.